Explicado: quais são as variantes do Covid-19 na Índia e elas explicam o aumento?

Descobriu-se que mais de 320 amostras de coronavírus são da linhagem do Reino Unido em Punjab. Isso explica o aumento recente? E quão difundidas estão as variantes da África do Sul e do Brasil, além de outras na Índia?

Em um shopping em Pune (foto expressa: Ashish Kale, arquivo)

Mais de 320 amostras de coronavírus do Punjab foram encontrados para ter a linhagem do Reino Unido , uma referência a uma nova cepa do vírus que surgiu no Reino Unido em dezembro, com mutações genéticas que permitiram sua propagação mais rápida. Esta é a ocorrência mais difundida da variante do Reino Unido na população indiana encontrada até agora e poderia explicar o rápido aumento de casos em Punjab nas últimas semanas.

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Um comunicado do governo na quarta-feira disse que 736 amostras de todo o país foram encontradas até agora com linhagem do Reino Unido. Além dessas, constatou-se que 34 amostras eram da linhagem sul-africana e uma, da linhagem brasileira. As variantes sul-africana e brasileira são duas outras cepas dominantes do coronavírus que circulam pelo mundo. As mutações genéticas nessas duas variantes as tornam mais propensas a escapar do sistema imunológico humano. Apreensão, portanto, é que as vacinas atuais possam ser comparativamente menos eficazes contra eles, embora isso ainda esteja sendo investigado.

Variantes na Índia

As variantes do Reino Unido, do Brasil e da África do Sul não são as únicas atualmente em circulação na população indiana. Como qualquer outro organismo, o coronavírus também está em constante mutação, com algumas mudanças em sua estrutura genética acontecendo a cada ciclo de replicação. A maioria dessas mutações é irrelevante e não altera a natureza geral ou o comportamento do coronavírus. Mas alguns deles, possivelmente um em milhares, podem introduzir mudanças importantes, ajudando o vírus a se adaptar ou sobreviver melhor.

Durante essa epidemia, três tipos de mudanças estão sendo observados com atenção - as que aumentam a capacidade do vírus de se espalhar mais rapidamente, as que causam doenças mais graves na pessoa infectada e as que ajudam o vírus a escapar da resposta imunológica.

As variantes do Reino Unido, Brasil e África do Sul são essas cepas. Cada um deles agora tem suas próprias famílias, o que significa que houve muitas mutações subsequentes, mas com a mutação definidora original permanecendo intacta. Essas três famílias variantes, ou linhagens, foram encontradas em vários países e são as principais responsáveis ​​pelo aumento de casos na Europa e no Brasil.

Além dessas, várias outras variantes estão circulando na população indígena, aquelas que têm originado localmente bem como outros que foram trazidos por viajantes do exterior. Mas nada disso foi classificado como uma variante de preocupação.

Variantes de Covid-19 detectadas na Índia

Variante e preocupações do Reino Unido Covid-19

Os cientistas sustentaram que nenhuma das três 'variantes de preocupação' - Reino Unido, Brasil ou África do Sul - pode estar ligada ao atual aumento de casos na Índia. Seu nível de prevalência na comunidade, a partir de agora, não é tão alto que o aumento atual possa ser atribuído a eles.

Mesmo em Punjab, onde 80% das 400 amostras analisadas revelaram ser a variante do Reino Unido, é muito cedo para culpar pelo aumento extraordinário de casos nas últimas semanas. Os resultados do sequenciamento do genoma foram revelados agora, e uma correlação clínica precisa ser feita para avaliar se eles são responsáveis ​​pelo aumento de casos.

Como os cientistas apontaram, se as pessoas infectadas com a cepa do Reino Unido em Punjab forem todos viajantes ou seus contatos diretos, suas ocorrências podem ser facilmente explicadas e não são muito preocupantes. No entanto, se também tiver sido encontrado em pessoas da comunidade em geral, há o perigo de se espalhar para outras pessoas muito rapidamente. Isso também significaria que os procedimentos de isolamento e quarentena que estão sendo seguidos no estado, especialmente para os viajantes, não foram seguidos à risca.

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Algumas mutações específicas encontradas na cepa do Reino Unido, como uma chamada E484Q e outra chamada N440K, foram observadas em algumas outras variantes também e estão circulando na população indiana há vários meses. No momento, não há evidências que sugiram que qualquer um desses fatores poderia ter levado ao segundo surto ou causado reinfecção em pacientes.

No entanto, investigações científicas muito mais detalhadas são necessárias para avaliar seu impacto na disseminação da doença na Índia.

Sequenciamento do genoma ...

A Índia tem o segundo maior número de pessoas infectadas com o coronavírus durante a epidemia. Mas fez muito poucas sequências de genoma das diferentes variantes em circulação. Até agora, realizou análises genéticas de 19.092 amostras de todo o país, de acordo com um comunicado feito pelo governo no Parlamento na semana passada. Isso inclui o sequenciamento de 10.787 amostras desde que o governo criou o INSACOG (Indian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) em dezembro especificamente para essa finalidade. Muitos outros países, incluindo os Estados Unidos e a China, analisaram mais de 100.000 sequências de genes.

O estudo das mudanças genéticas no organismo são pistas importantes para entender a origem, transmissão e impacto do vírus nos pacientes. O objetivo declarado do INSACOG é sequenciar as amostras de pelo menos 5% de todos os casos infectados por meio de uma rede de dez laboratórios. Isso parece uma tarefa muito difícil agora. A Índia registrou até agora mais de 1,17 milhões de casos positivos. As 19.092 amostras sequenciadas até agora representam apenas 0,16% desse número.

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... e por que está lento

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Uma das principais razões para o ritmo lento do sequenciamento do genoma é a falta de fundos. Até agora, nenhum dinheiro foi alocado para a INSACOG, embora as autoridades tenham dito que a aprovação dos fundos é esperada para qualquer dia. Os laboratórios têm usado dinheiro de seus próprios orçamentos anuais para fazer o trabalho de sequenciamento. Demora entre Rs 3.000 e Rs 5.000 para extrair a sequência do gene de uma amostra. O custo refere-se principalmente aos reagentes químicos necessários ao processo.

Além disso, os estados não têm enviado de forma proativa suas amostras aos laboratórios para sequenciamento. Maharashtra, que registrou mais de 25 lakh infecções até agora, enviou apenas cerca de 2.800 amostras para sequenciamento, de acordo com dados do governo apresentados no Parlamento. Isso é apenas cerca de 0,11% de todos os casos. Kerala enviou o maior número de amostras para sequenciamento, cerca de 5.200, mas Karnataka, que tem um número comparável de casos, enviou apenas 137 amostras. Uma taxa tão baixa de sequenciamento do genoma pode não ser estatisticamente significativa para tirar conclusões sobre a mudança na natureza e no comportamento do vírus, ou no planejamento de intervenções apropriadas para conter a propagação da epidemia.

Este artigo apareceu pela primeira vez na edição impressa em 25 de março de 2021 com o título ‘Cracking the virus strain’.

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