Explicado: O coronavírus mutado versus testes, vacinas
Novas vacinas e testes de coronavírus versus Covid-19: A variante de coronavírus em circulação no Reino Unido é definida por muitas mutações. Quais são particularmente preocupantes? Por que a OMS informou que pode escapar de alguns testes de PCR e pode impactar a vacinação?

Em informações emergentes sobre a nova variante do coronavírus SARS-CoV-2 circulando no Reino Unido, uma mutação tem sido uma preocupação particular. A variante, chamada de VUI 202012/01 e relatada como capaz de se transmitir mais rápido entre as pessoas, é definida por até 14 mutações e três deleções em seu material genético. De particular preocupação é uma mutação, N501Y. Embora o potencial da variante para impactar os resultados dos testes e vacinas ainda esteja sendo estudado, as autoridades de saúde estão bastante otimistas de que a maioria dos testes e vacinas ainda funcionará.
O que é uma mutação?
Uma mutação significa uma alteração no material genético. Em um vírus de RNA como o SARS-CoV-2, as proteínas são feitas de uma sequência de aminoácidos. Esse vírus contém cerca de 30.000 'pares de base', que são como tijolos colocados lado a lado para formar uma estrutura. Uma alteração nesta base pode ser uma mutação, mudando efetivamente a forma e o comportamento do vírus.
Na variante do Reino Unido, uma mutação tornou o vírus mais provável de se ligar a proteínas humanas chamadas de receptores. Isso é chamado de N501Y.
O que é N501Y?
Em palavras simples, o aminoácido representado pela letra N, e presente na posição 501 na estrutura genética do coronavírus, foi substituído nessa posição por outro aminoácido, representado por Y. A posição onde essa alteração ocorreu é no domínio de ligação ao receptor da proteína spike. (É a proteína de pico do vírus que se liga ao receptor humano.)
Portanto, a mutação aumentou a afinidade de ligação do coronavírus. O vírus mutado é responsável por 60% das infecções recentes em Londres.
De acordo com a base de dados da Global Initiative on Avian Influenza Data (GISAID), a mesma mutação no domínio de ligação ao receptor foi relatada de forma independente em vários países, incluindo África do Sul e Austrália. A análise de sequência mostrou que esta mutação se originou separadamente no Reino Unido e na África do Sul.
E quanto às outras mutações do coronavírus?
Mutações são comuns, mas a maioria delas não causa alteração na estrutura das proteínas que codificam - são chamadas de mutações 'sinônimas', pois acabam se traduzindo nos mesmos aminoácidos. Outro tipo é a mutação 'não sinônima', que pode resultar em uma mudança de aminoácido.
Na variante que circula no Reino Unido, há seis alterações sinônimas e quatorze mutações não sinônimas. Além disso, existem três 'deleções' - aminoácidos removidos da sequência.
Segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS), além do N501Y, as mutações que podem influenciar a transmissibilidade do vírus em humanos são P681H e HV 69/70.
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E o que são P681H e HV 69/70?
P681H : Esta mutação ocorreu no aminoácido presente em 681 - outra posição no domínio de ligação ao receptor. Aqui, o aminoácido P foi substituído por H. O Centro de Controle de Doenças dos Estados Unidos (CDC) disse que esse é um local com alta variabilidade em coronavírus, e essa mutação específica também surgiu espontaneamente várias vezes. A OMS disse que essa mutação é de importância biológica.
Os pesquisadores mostraram anteriormente que essa mutação pode promover a entrada nas células epiteliais respiratórias e a transmissão em modelos animais.
Amostras recentes sequenciadas no Centro Africano de Excelência para Genômica de Doenças Infecciosas, Redeemer’s University, Nigéria, mostraram a sequência P681H lá. No entanto, os pesquisadores afirmam que, no momento, não há evidências que indiquem que a variante P681H esteja contribuindo para o aumento da transmissão do vírus na Nigéria.
HV 69/70 : Esta mutação é o resultado de uma deleção de aminoácidos nas posições 69 e 70. Essas posições estão novamente na proteína spike do vírus. Essa exclusão também foi observada na França e na África do Sul. O CDC disse: Esta deleção dupla ocorreu espontaneamente muitas vezes e provavelmente leva a uma mudança na forma (ou seja, uma mudança conformacional) da proteína de pico.
Pesquisadores em nome do COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK), que marcou a nova variante no Reino Unido, disseram em seu relatório preliminar que essa exclusão também foi observada em um surto associado ao vison na Dinamarca. Em humanos, essa deleção foi associada a outra mutação, N439K, que novamente ocorreu no domínio de ligação ao receptor.
A OMS destacou que essa exclusão pode afetar o desempenho de alguns testes de RT-PCR que detectam o novo coronavírus.
Como isso pode afetar os testes de RT-PCR?
A OMS disse que a deleção nas posições 69/70 afetou o desempenho de alguns ensaios de PCR de diagnóstico que usam um 'alvo do gene S' (na proteína 'S' ou de pico). No entanto, a OMS também disse que a maioria dos ensaios de PCR em todo o mundo usa alvos múltiplos e, portanto, o impacto da variante no diagnóstico não deve ser significativo.
O CDC também disse que a maioria dos testes comerciais de PCR têm vários alvos onde detectam o vírus, de modo que mesmo que uma mutação afete um dos alvos, os outros alvos de PCR ainda funcionarão.
Na verdade, a infecção desencadeada pela nova cepa no Reino Unido também foi detectada pelo teste convencional de RT-PCR.
Os laboratórios que usam ensaios de PCR internos que têm como alvo o gene S do vírus também devem estar cientes desse problema potencial. A fim de limitar o impacto sobre as capacidades de detecção nos países, uma abordagem usando diferentes ensaios em ensaios paralelos ou multiplex visando diferentes genes virais também é recomendada para permitir a detecção de potenciais variantes decorrentes, a OMS havia recomendado.
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O CDC disse que as vacinas aprovadas pela Food and Drug Administration (FDA) dos Estados Unidos são policlonais, produzindo anticorpos que têm como alvo várias partes da proteína spike.
O vírus provavelmente precisaria acumular múltiplas mutações na proteína spike para escapar da imunidade induzida por vacinas ou por infecção natural.
E a OMS disse: Estudos de laboratório estão em andamento para determinar se esses vírus variantes têm propriedades biológicas diferentes ou alteram a eficácia da vacina. Não há informações suficientes no momento para determinar se esta variante está associada a qualquer alteração na gravidade da doença clínica, resposta de anticorpos ou eficácia da vacina.
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