Explicado: variante B.1.617 e o aumento de Covid-19 na Índia

Os dados de sequenciamento do genoma apresentaram evidências do 'duplo mutante' em 61% das amostras em Maharashtra. Mas se essa nova variante está impulsionando o aumento contínuo da Índia, só pode ser dito depois que mais dados estiverem disponíveis.

Trabalhadores da área de saúde preparam camas no Shehnai Banquet Hall em Nova Delhi, que foi convertido em uma enfermaria temporária para pacientes com Covid-9. (Foto expressa: Amit Mehra)

Durante uma reunião com os laboratórios distritais em Maharashtra na semana passada, o Instituto Nacional de Virologia (NIV) compartilhou dados limitados mostrando uma divisão de 361 amostras sequenciadas do genoma coletadas entre janeiro e março deste ano.

A descoberta do título de a análise : a presença de uma mutação dupla foi detectada em 220 - quase 61 por cento - das amostras. Esta dupla variante foi classificada na semana passada como a variante B.1.617.

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O que é B.1.617?

A variante B.1.617 do SARS-CoV-2 carrega duas mutações, E484Q e L452R. Ambos são encontrados separadamente em muitas outras variantes do coronavírus, mas foram relatados juntos pela primeira vez na Índia.

As duas mutações são encontradas na proteína spike do vírus. A proteína spike ajuda o vírus a se ligar aos receptores da célula humana e entrar em uma célula hospedeira.

A mutação E484Q é semelhante a E484K, uma mutação encontrada nas variantes do coronavírus no Reino Unido (linhagem B.1.1.7) e na África do Sul (B.1.351).

A mutação L452R foi encontrada em variantes de disseminação rápida na Califórnia (B.1.427 e B.1.429). Ele pode aumentar o poder de ligação das proteínas do pico com os receptores ACE2 nas células humanas, tornando-o mais transmissível. L452R também pode potencialmente aumentar a replicação viral.

Juntos, E484Q e L452R são mais infecciosos e podem evitar anticorpos.

Onde o B.1.617 foi encontrado?

Existem dados limitados. Foi relatado pela primeira vez em Maharashtra. Em janeiro, 19 amostras de vários distritos foram sequenciadas e B.1.617 foi encontrado em quatro. Em fevereiro, 234 amostras foram sequenciadas de 18 distritos, e 151 amostras - de pelo menos 16 distritos - tiveram essa variante. E em março, até 65 de 94 amostras tinham.

Até agora, os distritos de Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad e Chandrapur apresentaram fortes evidências da presença de B.1.617. Menos amostras foram sequenciadas em outros distritos, e a variante foi encontrada em alguns. O sequenciamento está pendente para mais amostras.

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Esta variante é mais virulenta?

Não há evidências até agora. A maioria dos pacientes pode ficar isolada em casa, embora a experiência clínica precise ser combinada com os dados de sequenciamento do genoma para gerar evidências científicas. Anedotas clínicas de médicos sugerem que a variante se espalha mais rápido, é mais infecciosa, pode infectar famílias inteiras, mas é menos virulenta e não causa dramaticamente mais hospitalizações.

A maioria dos pacientes é assintomática e essa é uma boa indicação. Mas, em números absolutos, muitos casos sobrecarregaram a infraestrutura de saúde, disse o Dr. Shashank Joshi, especialista da Força-Tarefa Maharashtra Covid.

Quanto se espalhou?

O Dr. Sujeet Singh, diretor do Centro Nacional de Controle de Doenças (NCDC), apontou que muito poucas amostras de Maharashtra foram sequenciadas até agora, e é muito cedo para tirar conclusões definitivas sobre a disseminação do duplo mutante. No entanto, o governo central relatou em março que 15-20 por cento das amostras em Maharashtra tinham essa variante; com base nos dados de sequenciamento mais recentes, sabemos que esse número é agora superior a 60 por cento.

Os médicos e administradores distritais em Maharashtra estão relatando que, ao contrário da primeira onda, famílias inteiras estão sendo infectadas na segunda onda. Isso pode indicar que as medidas de distanciamento físico e isolamento são inadequadas no domicílio ou que o vírus se tornou mais transmissível.

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B.1.617 poderia estar impulsionando o aumento contínuo de casos de Covid-19?

O Dr. Gangandeep Kang, professor de microbiologia do Christian Medical College, Vellore, disse que 60,9 por cento das amostras com esta variante provavelmente mostravam uma ligação entre a mutação e o pico - no entanto, para uma resposta precisa, pelo menos 1 por cento das amostras de Covid-19 deve ser sequenciado a cada semana. Com a Índia atualmente testando mais de 1 lakh de casos por dia, e isso se traduziria em cerca de 1.000 sequências de genoma todos os dias.

Também precisamos verificar quantas pessoas uma pessoa é capaz de infectar e o limite do ciclo de RT-PCR. Precisamos fazer rastreamento ao vivo. Os dados de janeiro têm pouco valor em abril, disse o Dr. Kang.

O Dr. Gautam Menon, professor da Ashoka University, Sonepat, e do Instituto de Ciências Matemáticas de Chennai, disse: O que temos é sugestivo, mas precisamos de mais dados de sequenciamento do genoma para entender qual variante está causando o número de novas infecções em diferentes estados ... Para sugerir que o aumento de casos se deve a essa variante dupla mutante, devemos ter mais pontos no tempo. Por exemplo, se pudéssemos dizer que detectamos 30 por cento desta variante em amostras em 30 de março e, em seguida, 40 por cento em amostras em 14 de abril, isso indicaria que a nova variante está dominando a propagação da doença.

O Dr. Menon também sublinhou a necessidade de uma maior transparência dos dados. É possível, embora cada vez mais improvável, que os casos também possam estar ligados à cepa anterior, disse ele. A menos que saibamos até que ponto o aumento pode ser atribuído à nova variante, não seremos capazes de determinar conclusivamente se relaxamentos no comportamento apropriado de Covid com a cepa mais antiga impulsionaram os aumentos ou se o aumento da infectividade da nova variante é o responsável.

O professor Vinod Scaria, cientista principal, CSIR -IGIB, concordou que não podemos afirmar de forma conclusiva que essas variantes estão impulsionando o aumento da segunda onda. No entanto, as evidências sugerem que, pelo menos em alguns estados, a linhagem B.1.1617 é predominante e pode estar contribuindo para o aumento dos casos, disse ele. Esta linhagem é definida por 15 variantes genéticas, incluindo seis variantes da proteína spike. Dois deles (E484Q e L452R) estão envolvidos no escape imunológico, bem como no aumento da infecciosidade, disse a professora Scaria.

A variante pode escapar das vacinas?

Novamente, os dados são limitados. Algumas pessoas foram infectadas após a primeira dose, mas não há dados sobre se suas amostras foram enviadas para sequenciamento do genoma.

Sabemos que a variante sul-africana é mais capaz de escapar da resposta imunológica. Sabemos que a variante do Reino Unido é a mais transmissível. Mas não sabemos nada sobre B.1.617 até agora, porque não estamos reunindo dados para tirar conclusões, disse o Dr. Kang.

O Dr. Menon sublinhou que, embora não se espere que as vacinas previnam a infecção, certamente previnem doenças graves e a morte. Esperamos que isso permaneça verdadeiro mesmo com a nova variante. A única solução de médio a longo prazo para lidar com a Covid-19 é as pessoas serem vacinadas.

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