Explicado: A mutação de vírus e a nova variante Covid-19 no Reino Unido
Variantes de SARS-CoV-2 do tipo Reino Unido de rápida disseminação também poderiam se desenvolver de forma independente na Índia. A ignorância não pode ser uma bênção. Um elemento básico da vigilância de doenças é a cobertura e densidade adequadas para capturar os eventos antes que eles se espalhem amplamente. Muito mais sequenciamento do genoma é crítico.
Passageiros do Reino Unido preenchem formulários no Aeroporto Internacional Chhtrapati Shivaji, em Mumbai. (Foto / arquivo AP) O ano de 2020 será lembrado pelo surgimento de um novo vírus - o SARS coronavirus 2 (SARS-CoV-2) e a pandemia Covid-19 que ele causou. Com mais alguns dias pela frente, 2020 está projetado para fechar com cerca de 84 milhões de casos confirmados de Covid-19 e mais de 1,8 milhões de mortes.
Apesar desta tristeza, este também tem sido um ano de esperança, com o desenvolvimento, teste e aprovação de vacinas em velocidade notável . Pela primeira vez, uma pandemia de doenças humanas seria controlada por vacinas em tempo real.
O Prêmio Nobel Joshua Lederberg, um dos pensadores mais influentes da biologia moderna, disse uma vez: A única maior ameaça ao domínio contínuo do homem no planeta é o vírus. Dois desenvolvimentos recentes nos lembram por que os vírus podem ser adversários tão formidáveis.
Com a descoberta de 58 pessoas com teste positivo para o novo coronavírus na Antártica , a pandemia atingiu todos os continentes. E um vírus mutante surgiu no Reino Unido, que ameaça fechar o mundo mais uma vez - um mundo apenas começando a se recuperar de bloqueios e restrições de movimento.
A mutação dos vírus
O material genético ou genoma do SARS-CoV-2 é um ácido ribonucléico (RNA) composto por mais de 30.000 unidades (chamadas de nucleotídeos). Entre as famílias de vírus de RNA, os coronavírus possuem o maior genoma. A maioria dos outros vírus de RNA tem em média cerca de 10.000 nucleotídeos. Quando os genomas se replicam - quaisquer genomas, seja DNA ou RNA, dos menores vírus aos humanos - ocorrem erros aleatórios (ou mutações). Embora os organismos superiores tenham a maquinaria para corrigir esses erros, os vírus e especialmente os de RNA, não.
A maioria das mutações é deletéria e esses vírus nunca são vistos. Apenas as mutações que oferecem alguma vantagem seletiva resultam na evolução de novas variantes virais.
A evolução também requer pressão de seleção. Para um vírus, isso poderia ser sua capacidade de infectar melhor e se multiplicar em números maiores ou escapar da imunidade do hospedeiro. A baixa probabilidade desses eventos é compensada pelas altas taxas de multiplicação de vírus. Por exemplo, cada célula infectada com coronavírus produz cerca de 1.000 novas partículas de vírus em menos de 12 horas.
O mutante no Reino Unido
Um grupo filogenético distinto ou linhagem (denominado B.1.1.7) de SARS-CoV-2 foi recentemente descoberto no Reino Unido. Os dois primeiros vírus desta linhagem foram coletados em 20 e 21 de setembro em Kent e na Grande Londres, respectivamente. Em 15 de dezembro, esta linhagem continha 1.623 vírus - 555 de Kent, 519 da Grande Londres, 545 em outras regiões do Reino Unido, incluindo Escócia e País de Gales, e quatro da Austrália, Dinamarca, Itália e Holanda.
Em outros dez dias - em 25 de dezembro - o número desses vírus variantes mais do que dobrou para 3.575; principalmente do Reino Unido, mas agora também da França, Irlanda, Israel, Hong Kong e Cingapura.
| Coronavírus mutado vs testes e vacinas
O que a mutação faz
Em comparação com as cepas SARS-CoV-2 originais, os vírus dessa linhagem acumularam 23 mutações em 5 genes. Destas, há 17 mutações não sinônimas e seis sinônimas; o primeiro também altera um aminoácido naquele local da proteína. É importante ressaltar que das 17 mutações não sinônimas, oito estão na proteína spike - a proteína que permite que o vírus se fixe e entre nas células.
A mutação N501Y em um dos resíduos de contato chave no domínio de ligação ao receptor (RBD) da proteína spike aumenta sua afinidade para o receptor ACE2. A mutação P681H no local de clivagem entre os domínios S1 e S2 da proteína spike promove a entrada em células suscetíveis e aumenta a transmissão em modelos animais de infecção.
A alteração do N501Y também está associada ao aumento da infecciosidade e virulência em modelos animais. Ambas as mutações foram observadas anteriormente de forma independente, mas se juntaram nos vírus variantes do Reino Unido. O resultado é um vírus que se espalha mais rápido do que antes.
O especialista
O Dr. Shahid Jameel é um dos virologistas mais conhecidos da Índia. Atualmente, o Diretor da Trivedi School of Biosciences na Ashoka University, ele trabalhou anteriormente para o Centro Internacional de Engenharia Genética e Biotecnologia, com sede em Delhi, e depois atuou como Executivo-Chefe da Wellcome Trust / DBT Alliance, que financia pesquisas em saúde.
O motivo de preocupação ...
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Há uma preocupação generalizada de que essas mutações possam impedir que os testes usados atualmente detectem o vírus, torná-lo mais letal ou permitir que evite vacinas em desenvolvimento. Não há evidências até agora para qualquer um deles. Afinal, essas variantes foram encontradas em pessoas que foram identificadas como positivas com os testes RT-PCR atualmente disponíveis.
No entanto, embora não haja evidências de doença mais grave, há evidências claras de que essa variante é mais contagiosa. Os infectados produzem mais vírus no nariz e na garganta, o que leva a mais disseminação do vírus e maior transmissão de pessoa para pessoa.
Embora essas variantes pareçam não ser mais letais, com mais pessoas infectadas haveria um número maior (não porcentagens) de infecções graves e mortes. Isso deve ser motivo de preocupação.
… E razão para não
Mesmo que existam várias mutações na proteína do pico, a maioria dos especialistas acredita que as vacinas atualmente em desenvolvimento também funcionariam nos vírus variantes. Vineet Menachery, professor assistente de microbiologia e imunologia da University of Texas Medical Branch em Galveston, nos Estados Unidos, forneceu a primeira evidência disso.
Seu laboratório comparou a eficácia de amostras de soro de pacientes recuperados de Covid-19 para neutralizar vírus com ou sem a mutação N501Y. Eles não encontraram nenhuma diferença. Embora compartilhados apenas no Twitter em 23 de dezembro e ainda não fazendo parte de uma publicação, esses resultados são encorajadores e tranquilizadores.
Os viajantes olham para os painéis de informações na estação King's Cross, enquanto os países da UE proíbem viagens do Reino Unido após o surto do coronavírus, em Londres, Grã-Bretanha, em 21 de dezembro de 2020. (Reuters Photo) Vôos desligados, não mutação
A Índia interrompeu todos os voos do Reino Unido e aumentou a vigilância nos aeroportos para impedir a importação de variantes altamente transmissíveis. Embora pareçam ser uma estratégia razoável, essas variantes também podem se desenvolver facilmente dentro do país. Afinal, a Índia tem mais de 10 milhões de infecções confirmadas e estima-se que 150 a 200 milhões de pessoas já estejam infectadas.
Uma variante de disseminação rápida chamada 501.V2 surgiu independentemente na África do Sul e compartilha a mutação N501Y com as variantes do Reino Unido. Embora a variante N501Y de pico ainda não tenha sido encontrada na Índia, os vírus com a mutação P681H começaram a emergir em julho e atualmente 14% do SARS-CoV-2 que circula na Índia carrega essa mutação.
Esses vírus são principalmente de Maharashtra, com alguns também de West Bengal. Bastaria mais uma mutação para chegarmos onde o Reino Unido está hoje. E isso também deve nos preocupar na Índia.
A reação rápida é a chave
Para detectar o surgimento de novas variantes virais antes que se espalhem amplamente na população, a Organização Mundial da Saúde (OMS) recomenda determinar a sequência genômica do vírus em pelo menos um em cada 300 casos confirmados (ou 0,33%). O Reino Unido sequenciou 135.572 ou 6,2% de variantes virais de 2,19 milhões de casos, enquanto a África do Sul e os EUA relataram sequências de genoma de 0,3% dos casos confirmados.
No entanto, a Índia até agora sequenciou apenas 4.976 ou 0,05% dos vírus de seus mais de 10 milhões de casos. Nesse ritmo, permaneceremos alheios ao surgimento de novas variantes até que seja tarde demais. Um elemento básico da vigilância de doenças é a cobertura e densidade adequadas para capturar os eventos antes que eles se espalhem amplamente.
Um casal atravessa a rua carregando um guarda-chuva e sacolas de compras, em Mayfair, antes das novas medidas de restrição Tier-4, em Londres, sábado, 19 de dezembro de 2020. (AP Photo) Condições indianas favoráveis
Outro motivo de preocupação é que as condições hipotetizadas para dar origem à variante do Reino Unido também estão presentes na Índia. Pacientes imunodeficientes ou imunossuprimidos, que se tornam cronicamente infectados com SARS-CoV-2, permanecem positivos para RNA viral por 2-4 meses em vez das 2-3 semanas habituais. Esses pacientes são freqüentemente tratados com plasma convalescente (às vezes mais de uma vez) e geralmente também com o remdesivir.
O sequenciamento do genoma do vírus de tais pacientes revelou um número invulgarmente grande de alterações de nucleotídeos. A diversidade genética intra-paciente do vírus também é conhecida por aumentar após a terapia de plasma. O mau estado nutricional é uma causa conhecida para o enfraquecimento do sistema imunológico e os médicos na Índia relataram infecção crônica em um subconjunto de pacientes.
Várias incógnitas permanecem
A terapia plasmática e o remdesivir também foram amplamente usados para tratar pacientes com Covid-19 na Índia. Além disso, o plasma foi administrado na Índia sem primeiro testar os níveis de anticorpos neutralizantes. Tudo isso cria oportunidades para que variantes do tipo do Reino Unido surjam também na Índia. Mas não sequenciamos o suficiente para saber se isso aconteceu.
Mesmo com cobertura baixa, as sequências da Índia são distorcidas para locais urbanos, especialmente os metrôs onde os laboratórios de sequenciamento estão localizados. Isso precisa de uma cobertura mais ampla para incluir todas as partes do país. O Conselho Indiano de Pesquisa Médica pode facilitar esse processo, fornecendo acesso a amostras de pacientes de Covid-19 a laboratórios de pesquisa com capacidade para sequenciamento genômico e análise de dados. A vigilância em tempo real fornecerá dados densos e granulares para definir políticas com base em evidências.
A Índia interrompeu todos os voos do Reino Unido e aumentou a vigilância nos aeroportos para impedir a importação de variantes altamente transmissíveis. (Foto expressa: Partha Paul) Avançando com ‘SMS’
Quando as vacinas são distribuídas de forma mais ampla, haveria mais pressões de seleção para que o vírus mudasse. Os mutantes de escape da vacina são bem conhecidos para outros vírus e surgirão também para o SARS-CoV2. Somente a vigilância genética adequada detectará qualquer falha da vacina a tempo.
À medida que entramos em 2021, a mensagem para os formuladores de políticas e o público é clara. Aqueles que supervisionam a saúde pública devem buscar continuamente novas evidências para fazer políticas no nível da população. No nível individual, cada um de nós deve trabalhar para reduzir a transmissão do vírus - menos transmissão significa menos oportunidade para o vírus mudar. E o SMS é a única ferramenta disponível para nós no momento - distanciamento social , máscaras e higienização.
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